Als Grund für seinen Austritt gab Haggis unter anderem die Haltung der Sekte gegenüber Homosexuellen an, heißt es in einem Brief Haggis' an Scientology-Vertreter Tommy Davis. Er könne "nicht guten Gewissens Mitglied in einer Organisation sein, in der die Diskriminierung von Schwulen toleriert" werde. "Schweigen ist Zustimmung, Tommy", heißt es in dem Brief von 19. August. "Und ich will nicht zustimmen."
Der Brief wurde in einem Blog über Scientology veröffentlicht und seitdem im Internet weiterverbreitet. Haggis Sprecher Ziggy Kozlowski bestätigte, dass das Schreiben von dem Regisseur stammt. Es sei nicht für die Öffentlichkeit bestimmt gewesen.
Haggis schreibt darin außerdem, Scientology fordere die Trennung seiner Mitglieder von Angehörigen und Freunden, die der Sekte ablehnend gegenüberstehen, dementiere dies aber in der Öffentlichkeit. Seine Frau Deborah Rennard sei zu diesem Verhalten aufgefordert worden und habe über ein Jahr nicht mit ihren Eltern gesprochen. Davis wies Haggis Aussagen als Missverständnisse zurück.
Einblicke ins Innenleben der Sekte
Der Brief von Haggis gewährt einen seltenen Einblick in die Kommunikation zwischen der Organisation und einem ihrer prominenten Mitglieder. Nur gelegentlich gelangen interne Dokumente der Scientology an die Öffentlichkeit. Im vergangenen Jahr war dies ein Werbe-Video mit dem vielleicht bekanntesten Scientology-Mitglied, Tom Cruise.